مریم میرزاخانی در 22 اردیبهشت 1356ش در شهر تهران دیده به دنیا گشود.  مریم چهارمین فرزند خانواده بود. پدرش مسئول یک مرکز نیکوکاری بود و مریم نیز به فعاليت در اين مرکز خیریه علاقمند بود و به‌عنوان یکی از فعالان گروه همیاری جوانان به موضوع توانمندسازی افراد دارای معلولیت اهتمام می‌ورزید. او در دوران کودکی آرزوی نویسنده شدن را در سر می‌پروراند و خواندن رمان، یکی از سرگرمی‌های روزانه‌اش بود. در میانه این دوران شیرین دخترانه، برادر بزرگترش پنجره‌ای از دانش ریاضی را به روی وی گشود و با مطرح کردن راه حل جمع اعداد یک تا 100 به روش خاص، فهمی دلنشین از دانش ریاضی را به مریم هدیه کرد.